Žinynas
Žinių pagrindai
Tyrinėkite sąvokas, dėsnius, lygtis ir metodus, jų taikymą ir šaltinius. Pasirinkite pažinimo sritį arba raskite konkretų žinyno įrašą.
Daugiau filtrų
Biologiniai duomenys ir metodai
Rodoma įrašų: 1–29 iš 29
GUIDE-seq aptinka pažymėtų dvigrandžių trūkių vietas integruojant oligonukleotidus ir atliekant sekoskaitą.
MetodasBiologijaAplinkos RNR ir ląstelių atpažinimo atrankaEmptyDrops tikrina brūkšniniais kodais žymimų mėginių genų raišką pagal aplinkos RNR nulinę hipotezę, užuot rėmęsis vien bendro skaičiaus slenksčiais.
MetodasBiologijaMolekuliniai brūkšniniai kodai ir neužfiksuoti duomenysUMI padeda atskirti amplifikuotus sekoskaitos skaitinius nuo užfiksuotų molekulių, tačiau brūkšninių kodų klaidos ir ribotas molekulių užfiksavimas veikia įvertintus skaičius.
MetodasBiologijaIšnagrinėtas difuzijos sukeltas nestabilumasLecuit bedimensiame dviejų ląstelių pavyzdyje izoliuotos reakcijos Jakobio matricos tikrinės vertės yra −1, o antisimetriška erdvinė moda gali tapti nestabili, kai ląstelės susiejamos nevienoda difuzine pernaša.
Matematinis teiginysBiologijaYAP/TAZ mechaninių signalų perdavimas: intervencinis tyrimasDupont ir kolegos keitė substrato standumą bei ląstelių geometriją ir tyrė aktomiozino/Rho bei YAP/TAZ atsakus nurodytose kultivuojamose žinduolių ląstelėse.
Empirinis rezultatasBiologijaCas9 skaidymas: pirminiai biocheminiai duomenysJinek ir kolegos pademonstravo RNR programuojamą dvigrandės DNR skaidymą Cas9 baltymu in vitro ir sulietos kreipiančiosios RNR architektūrą.
Empirinis rezultatasBiologijaBazių redagavimo chemija ir reparacijos kontekstasCitidino bazių redaktoriai sujungia deaminazę su į DNR nukreiptu Cas9 aparatu; UGI ir vienos DNR grandinės įkirpimo modifikacijos nukreipia apdorojimą pageidaujamų pakaitų link.
MetodasBiologijaPirminis redagavimas ir programuoti reparacijos tarpiniai produktaiPirminis redagavimas sujungia sulietą Cas9 nikazės ir atvirkštinės transkriptazės baltymą su pegRNR, kurioje užkoduotas norimas pakeitimas.
MetodasBiologijaRedagavimo tyrimai: atrinkti produktai ir nepriklausomas fenotipasAmplikonų, turinčių numatytą pakeitimą, dalis apibūdina tirtą išlikusių ląstelių populiaciją ir lokusą.
MetodasBiologijaŽmogaus genomo redagavimas: įrodymai ir valdymo aprėptisPSO žmogaus genomo redagavimo sistemoje skiriamas somatinių ląstelių redagavimas, gemalinės linijos redagavimas ir paveldimas redagavimas; raginama užtikrinti priežiūrą, skaidrumą ir atsakingą valdymą.
MetodasBiologijaLokalizavimas pagal struktūruoto apšvietimo minimumus ir neapibrėžtisMINFLUX naudoja erdvėje išdėstytus sužadinimo minimumus fluorescencinio spinduolio vietai nustatyti pagal aptiktus fotonus.
MetodasBiologijaMedžiagų apykaitos alometrija ir lyginamųjų tyrimų kontrolėPagal duomenis priderintas medžiagų apykaitos ir kūno masės ryšys priklauso nuo bazinės būsenos kriterijų, temperatūros, rūšių imties ir regresinės analizės metodo.
ModelisBiologijaSusieti šilumos, vandens ir energijos balansaiMechanistiniai nišos modeliai susieja mikroklimatą su organizmo šilumos, vandens ir maistinių medžiagų balansais per visą gyvenimo ciklą.
ModelisBiologijaBiologiniai pakartojimai pavienių ląstelių duomenų analizėjeIš vieno gyvūno ar vienos kultūros paimtos ląstelės turi bendrą eksperimento istoriją.
MetodasBiologijaCITE-seq: suporuoti rodmenys, skirtingi matavimaiCITE-seq sujungia antikūnais gaunamas epitopų žymas su transkriptomo profiliavimu toje pačioje paimtoje ląstelėje.
MetodasBiologijaSerijos efektų korekcija ir biologinis identifikuojamumasIntegruojant siekiama suderinti duomenų rinkinius ir išsaugoti biologinius skirtumus.
MetodasBiologijaErdviniai matavimai ir kaimynystės priklausomybėErdvinė transkriptomika išsaugo koordinates, tačiau stebimasis dydis priklauso nuo platformos: molekulių surinkimu pagrįstuose taškuose gali susimaišyti kelių ląstelių signalai, o vaizdinimu pagrįsti rinkiniai matuoja pasirinktus transkriptus.
MetodasBiologijaLąstelių būsenų trajektorijos ir stebima kilmės linijaLąstelių išrikiavimas pagal transkripcijos trajektoriją apibūdina atrinktų būsenų panašumus.
MetodasBiologijaRNR greitis ir kinetinės prielaidosRNR greitis apskaičiuojamas pagal splaisintos ir nesplaisintos RNR santykius, siekiant įvertinti lokalią raiškos pokyčio kryptį pagal transkripcijos, splaisingo ir degradacijos modelį.
ModelisBiologijaSpatial Perturb-Seq: 2026 m. nepažeisto audinio duomenysSpatial Perturb-Seq sujungia AAV pernešamus genetinių perturbacijų brūkšninius kodus su erdvinės transkriptomikos matavimo duomenimis tirtame Cas9 pelės hipokampe.
Empirinis rezultatasBiologijaReguliacinių tinklų perkeliamumasAr pagal perturbaciją nustatytas reguliacinis ryšys išlieka kitame audinyje, raidos etape ar aplinkoje, yra atskiras klausimas nuo atsako aptikimo viename eksperimente.
Atviras klausimasBiologijaKonformacinė atranka ir indukuotasis prisitaikymasKonformacinė atranka ir indukuotasis prisitaikymas apibūdina konkuruojančius konformacijos pasikeitimo ir ligando prisijungimo įvykių eiliškumo kelius.
ModelisBiologijaAlphaFold 3 prognozės ir fizikinis mechanizmasAlphaFold 3 prognozuoja biomolekulinių kompleksų struktūras, tačiau nurodo apribojimus, tarp jų atomų persidengimus, stereochemines klaidas ir išgalvotas sritis.
MetodasBiologijaDifuzija grįstas projektavimas ir nepriklausomas patvirtinimasRFdiffusion generuoja siūlomas baltymų pagrindines grandines ir projektus su nustatytais apribojimais.
MetodasBiologijaHDX atsivėrimo energijos ir modelio prielaidosEX2 atsivėrimo modelyje mainų greičiai apriboja apytiksles atsivėrimo laisvosios energijos vertes.
MetodasBiologijaIšmatuoti baltymų energijos kraštovaizdžiai: 2026 m. tyrimasFerrari ir kolegos apibūdina 5,778 mažus domenus taikydami multipleksinę HDX-MS ir palygina 13 domenų taikydami atskiras vietas išskiriantį HDX BMR metodą.
Empirinis rezultatasBiologijaDifuzijos sukeltas nestabilumas ir raštų formavimasis vystantisTuringas pasiūlė, kad reaguojantys ir difunduojantys morfogenai gali destabilizuoti iš pradžių vienalytę pusiausvyrą ir sukurti erdviškai struktūruotas būsenas.
ModelisBiologijaLąstelės trauka kaip atvirkštinis mechanikos uždavinysTraukos jėgų mikroskopija leidžia nustatyti jėgas iš ląstelės sukeltų substrato poslinkių, naudojant substrato mechanikos modelį.
MetodasBiologijaFunkcinių kraštovaizdžių prognozavimas pagal struktūrasKonformacijų laisvųjų energijų, kinetikos ir funkcijos prognozavimas pagal seką ar statines struktūras tebėra neišspręstas mokslinių tyrimų iššūkis.
Atviras klausimas