GLOBAL KNOWLEDGE ARK

Žinynas

Žinių pagrindai

Tyrinėkite sąvokas, dėsnius, lygtis ir metodus, jų taikymą ir šaltinius. Pasirinkite pažinimo sritį arba raskite konkretų žinyno įrašą.

Daugiau filtrų

Žinyno įrašai

Rodoma įrašų: 961–990 iš 1709

BiologijaGenų srautas dėl pakeitimo migrantais

Jei migrantai sudaro nustatytą populiacijos alelių fondo dalį, alelio dažnis po migracijos yra vietinių individų ir migrantų alelio dažnių svertinis vidurkis.

Modelis
BiologijaPasikartojančios mutacijos ir gryninamoji atranka

Pasikartojančios mutacijos gali papildyti žalingojo alelio, kurį šalina gryninamoji atranka, atsargas.

Artinys
BiologijaNeutralių alelių fiksacija ir pakaitų dažnis

Idealioje neutralioje diploidinėje populiacijoje naujo alelio, kurio yra viena kopija, galutinės fiksacijos tikimybė yra 1/(2N).

Modelis
BiologijaMolekulinė divergencija, kalibravimas ir laikrodžio ribos

Kai abiejų palikuonių linijų substitucijų greičiai yra vienodi ir pastovūs, tikėtinos jas skiriančios substitucijos kaupiasi abiejose šakose nuo bendro protėvio.

Modelis
ChemijaKoordinacinė geometrija ir chirališkumas

Koordinacinių junginių sudėtis gali būti vienoda, tačiau ligandų jungimosi būdas arba erdvinis išsidėstymas gali skirtis.

Apibrėžimas
ChemijaMetalo valentinių elektronų skaičiavimas ir 18 elektronų euristika

Neutraliųjų fragmentų ir oksidacijos laipsnio metodais ligandų ir metalo elektronai priskiriami nuosekliai, jei visame skaičiavime laikomasi pasirinkto metodo taisyklių.

Metodas
ChemijaLigandų pakeitimas, labilumas ir termodinaminis stabilumas

Disociacinio ligandų pakeitimo metu ligandas atsiskiria prieš prisijungiant kitam, o asociacinio mechanizmo atveju naujas ligandas prisijungia prieš atsiskiriant ankstesniam.

Modelis
ChemijaKovalentiniai ligandų laukai ir metalo–ligando π sąveikos

Ligandų lauko molekulinių orbitalių (MO) modeliai sujungia suderinamos simetrijos metalo ir ligandų orbitales, papildydami taškinių krūvių kristalinio lauko modelį kovalentinėmis sąveikomis.

Modelis
ChemijaJoniniai hidridai ir vandenilio junginių rūgštinės bei bazinės savybės

Joniniame hidride vandenilis formaliai yra H− ir gali veikti kaip stipri bazė arba reduktorius; vykstant protono pernašai iš vandens, susidaro vandenilio dujos ir hidroksido jonas.

Modelis
ChemijaBoro Luiso rūgštingumas ir silicio–deguonies karkasai

Boro trihalogenidų žinyninės molekulinės struktūros yra trikampės plokščiosios, ir jie gali priimti donorų elektronų poras; BF3 ir fluorido jonas sudaro BF4−.

Modelis
ChemijaAzoto oksidai, elektronų skaičiaus lyginumas ir pusiausvyra

Azotas sudaro oksidus, kuriuose jo formalusis oksidacijos laipsnis gali būti skirtingas.

Modelis
ChemijaFosforo oksidai, halogenidai ir nuo fazės priklausanti sandara

Fosforo(III) ir fosforo(V) oksidai skiriasi deguonies kiekiu ir formaliaisiais oksidacijos laipsniais.

Modelis
ChemijaDeguonies dalelės ir sieros redokso įvairovė

Oksido O²−, peroksido O₂²− ir superoksido O₂− jonai skiriasi deguonies atomų ir elektronų skaičiumi bei išsidėstymu.

Modelis
ChemijaHalogenų redokso savybės ir tauriųjų dujų inertiškumo ribos

Halogenų ir halogenidų oksiduojamasis ir redukuojamasis vaidmenys skiriasi; pavyzdžiui, tinkamomis tirpalo sąlygomis chloras gali oksiduoti bromido jonus.

Modelis
ChemijaHidroborinimas–oksidacija ir stereocheminis papildomumas

Elementariajame alkenų hidroborinimo modelyje C–H ir C–B ryšiai susidaro kartu iš tos pačios pusės, nesusidarant laisvam karbokationui kaip tarpiniam junginiui.

Modelis
ChemijaAlkinų hidratacija ir enolio virsmas karboniliniu junginiu

Prie alkino prijungus hidratacijos ekvivalentus, iš pradžių susidaro enolis, kuris gali tautomerizuotis į karbonilinį junginį.

Modelis
ChemijaAktyvintoji aromatinė pakaita prisijungimo–eliminavimo būdu

Nukleofilas gali prisijungti prie aktyvintos arilo sistemos, sudarydamas anijoninį tarpinį junginį, o vėliau atsiskiriant išeinančiajai grupei atkuriamas aromatiškumas.

Modelis
ChemijaAminų protonavimas ir azoto laisvosios elektronų poros prieinamumas

Amino bazingumą galima apibūdinti jo konjuguotosios amonio formos rūgštingumu nurodytomis sąlygomis.

Modelis
ChemijaGrandininė polimerizacija aktyviajame centre

Grandininės polimerizacijos metu monomero prisijungimas regeneruoja augančios grandinės aktyvųjį centrą.

Modelis
ChemijaPakopinė polimerizacija per funkcines grupes

Vykstant pakopinei polimerizacijai, jungiasi suderinamos monomerų ir oligomerų funkcinės grupės, o ne reikalaujama, kad visas augimas vyktų viename išliekančiame grandinės centre.

Modelis
Chemija · BiologijaJungimasis prie vienos vietos, laisvasis ligandas ir afinitetas

Esant grįžtamosios receptoriaus ir ligando sąveikos santykiu vienas su vienu pusiausvyrai, disociacijos konstanta susieja laisvojo receptoriaus, laisvojo ligando ir komplekso koncentracijas.

Modelis
Chemija · BiologijaAlosterinis susiejimas ir kooperatyvusis jungimasis

Ligando prisijungimas vienoje vietoje gali pakeisti afinitetą arba aktyvumą kitoje vietoje dėl baltymo būsenų susiejimo.

Modelis
ChemijaKulonometrija ir konkrečios reakcijos krūvio apskaita

Kulonometrija leidžia nustatyti reaguojančios medžiagos kiekį pagal integruojant apskaičiuotą krūvį ir elektronų stechiometriją.

Metodas
ChemijaVoltamperometrija, pernaša ir elektrodų srovės duomenys

Voltamperometrijoje registruojama srovė, valdant darbinio elektrodo potencialą palyginamojo elektrodo atžvilgiu; per pagalbinį elektrodą teka balansinė srovė.

Metodas
ChemijaFluorescencijos našumas ir analizinio atsako tiesiškumas

Fluorescencinė emisija vyksta po optinio sužadinimo ir konkuruoja su nespinduline relaksacija.

Metodas
BiologijaOrganelių endosimbiotinės kilmės įrodymai

Mitochondrijų ir plastidžių kilmę pagrindžia jų molekulinių sistemų ir genų giminingumas bakterijoms, organelių dauginimasis ir daugelio iš organelių kilusių genų perkėlimas į branduolio genomus.

Modelis
BiologijaSamanūnų gametofitai ir priklausomi sporofitai

Samanos, kerpsamanės ir ylvaisiai iliustruoja sausumos augalų gyvenimo ciklus, kuriuose vyrauja gametofitas.

Modelis
BiologijaBesėkliai induočiai ir kartų kaita

Pataisūnų ir paparčiams giminingų evoliucinių linijų sporofitai turi apytakos audinius, o jų gyvenimo cikluose gametofitai išsivysto iš sporų.

Modelis
BiologijaProtėvinis polimorfizmas ir genų bei rūšių medžių neatitikimas

Genų linijos nebūtinai koalescuoja populiacijos ar rūšies skilimo metu.

Modelis
BiologijaFilogenetinė kovariacija ir lyginamieji požymių metodai

Rūšių požymiai gali koreliuoti, nes giminingos linijos turi bendrą evoliucinę istoriją.

Metodas
ModelisPatikrinta pagal šaltinius

Molekulinė divergencija, kalibravimas ir laikrodžio ribos

Biologija

Kai abiejų palikuonių linijų substitucijų greičiai yra vienodi ir pastovūs, tikėtinos jas skiriančios substitucijos kaupiasi abiejose šakose nuo bendro protėvio.

Esminės žinios

Kai abiejų palikuonių linijų substitucijų greičiai yra vienodi ir pastovūs, tikėtinos jas skiriančios substitucijos kaupiasi abiejose šakose nuo bendro protėvio. Norint sekų divergenciją perskaičiuoti į praėjusį laiką, reikia substitucijų modelio ir kalibruoto greičio arba nepriklausomų laiko apribojimų. Greičio kitimas, pakartotinės substitucijos toje pačioje pozicijoje ir genų medžio protėviniai ryšiai neleidžia stebimų neatitikimų automatiškai laikyti rūšių divergencijos data.

Vertės ir lygtys

E[d] = 2rt

d
nustatytas nukleotidų pakaitų skaičius vienoje sekos pozicijoje tarp evoliucinių linijų substitutions per site
r
pastovus nukleotidų pakaitų greitis kiekvienoje evoliucinėje linijoje site⁻¹ time-unit⁻¹
t
laikas nuo bendro protėvio, išreikštas tuo pačiu laiko vienetu time unit

Sąlygos ir taikymo ribos

  • Pateikta tikėtinoji vertė grindžiama prielaida, kad abiejose evoliucinėse linijose greitis r yra vienodas ir nukleotidų pakaitų skaičius vienoje sekos pozicijoje nustatytas teisingai.
  • Geno bendras protėvis gali būti ankstesnis už populiacijų / rūšių atsiskyrimą; neteigiama, kad egzistuoja universalus molekulinis laikrodis.
Šaltiniai · 2

Šaltiniai

Šaltiniai išlaiko savo taikymo ribas. Vien nuoroda nepatvirtina kiekvieno teiginio patikrinimo.

  1. Lecture 11: Two-Lineage Divergence and Constraint, slides 4–9Graham Coop — UC Davis, undergraduate Population and Quantitative Genetics EVE 102 (2016)Vadovėlio skyrius · PDFgcbias.orgSkaityti šaltinį
  2. Figures of Incomplete Lineage Sorting: ancestral-polymorphism simulations and captionsGraham Coop, University of California Davis, 2015Vadovėlio skyriusgcbias.orgSkaityti šaltinį

Pagrindimas ir peržiūra

Perskaityta 11 paskaitos 4–9 skaidrėse pateikta neutralaus molekulinio laikrodžio išraiška 2Tμ ir greičio bei apribojimų aptarimas, taip pat tiesiogiai patikrinti ILS modeliavimo paaiškinimai, kuriuose sekamas protėvių polimorfizmas populiacijoms atsiskiriant. Šie paaiškinimai pagrindžia su geno protėvių istorija susijusį apribojimą, o ne universalią nekintamą tikimybę ar atkurtą kiekvienos rūšies istoriją.

2026-10-10 · Nepriklausoma DI redakcinė peržiūra: nepriklausomai perskaityti visi 115 faktiniai glausti teiginiai, hipotezės, lygčių, kintamųjų ir vienetų lentelės bei 251 kilmės semantinės sąsajos. Įvertintos visos tikslios autoriaus susiejimo su šaltiniais eilutės ir nurodyta patikros apimtis; toliau pakartotinai patikrinti pasirinkti originalūs tekstai arba konkrečiai nurodytos indeksuotos pirminių šaltinių ištraukos. Visi palikti glausti biologijos įrašai perskaityti siekiant įvertinti bendrą aprėptį. Nepriklausoma DI redakcinė turinio ir praktinio bendrojo pagrindo inventoriaus peržiūra; tai nėra žmogaus specialisto peržiūra, akademinio laipsnio ar laboratorinių gebėjimų patvirtinimas, viso vadovėlio sertifikavimas ar eksperimentinis atkartojimas. Patvirtinimo įrašas: biology-independent-content-inventory-review.1.

Įrašo informacijaNuolatinė nuoroda į šį įrašą ↗
Įrašo identifikatorius
uni-bio-molecular-clock
Versija
core.1
Struktūruotas žinyno įrašas
Universitetinių pagrindų plėtra